С июля 2011 года в Центре начало функционировать специализированное отделение экспресс-лаборатории. В структуре экспресс-лаборатории имеются следующие клинические подразделения диагностического профиля:
- биохимический отдел
- общеклинический отдел
- отдел гемостаза
- отдел гематологии
Основным направлением отделения является круглосуточное выполнение срочных анализов реанимационным, операционным, а также пациентам Центра, нуждающимся в срочном лабораторном обследовании.
Лаборатория Центра снабжена всеми необходимыми реактивами и аппаратурой для осуществления общеклинических, биохимических, гематологических, коагулологических анализов биологического материала пациента. Все исследования выполняются на самом современном оборудовании, используются только высококачественные реагенты, отвечающие требованиям международных стандартов.
В лаборатории работают врачи-лаборанты и лаборанты с высшей, первой и второй категориями, владеющие в 
семи методиками исследований на новейших анализаторах, таких как биохимический Cobas Integra 400, газовый анализатор Cobas b 121 Omni C, анализатор электролитов AVL9180, коагулометр Start 4, гематологический анализатор CellDyn 1800, криоскопический осмометр Osmomat 030, соответствующих требованиям международных стандартов.
Заведующая отделением - Аткенова Раушан Кабылбековна, врач-лаборант высшей категории.
